本文目录一览

1,什么是基因的上调和下调

上调就是基因转录成mRNA时受到正向调控,促进表达。下调是受到抑制,表达量减少。

什么是基因的上调和下调

2,基因表达调控中说的上调和下调是什么意思

调控结果使基因表达水平提高的称为正性调控(上调),使基因表达水平降低者为负性调控(下调)

基因表达调控中说的上调和下调是什么意思

3,基因表达中上调和下调n什么意思

酸性体质,酸性环境。健康的体质呈弱碱性,身体酸性化,会促使人体老化、病变;人体老化、病变,会促使身体酸性化。1克螺旋藻相当于1000克的蔬菜水果的总和,螺旋藻是碱性物质,阻止体内细胞变异,使得病毒不能复制。癌细胞只能在酸性环境中存活。盐藻阻止癌细胞增长效果更好。
虽然我很聪明,但这么说真的难到我了

基因表达中上调和下调n什么意思

4,如何解释miRNA上调靶基因也上调

一个基因上调一个基因下调是什么关系简单的说,基因组是一个物种全部基因的集合体。基因组,是指一个细胞或者生物体所携带的一套完整的单倍体序列,包括全套基因和间隔序列。可是基因组测序的结果发现基因编码序列只占整个基因组序列的很小一部分。因此,基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子。说的更确切些,核基因组是单倍体细胞核内的全部 DNA分子;线粒体基因组则是一个线粒体所包含的全部DNA分子;叶绿体基因组则是一个叶绿体所包含的全部DNA分子。
使用计算机预测植物mirna靶基因比较简单,因为在植物中mirna与靶基因几乎还是以完全互补配对的方式结合,预测不需要复杂的算法。而预测动物mirna靶基因则存在一定的困难,主要是目前已知的mirna靶基因及其确切靶点不多,在算法编写时没有足够的已知样本可供参考。但是,mirna与靶基因间的相互作用仍然具有一定的规律性。目前常规的算法主要遵循以下几个常用原则:(a)mirna与靶基因的互补性;(b)mirna靶位点在不同物种之间的保守性;(c)mirna-mrna双链之间的热稳定性;(d)mirna靶位点不会有复杂的二级结构;(e)mirna 5端于靶基因的结合能力强于3端。除了这些基本原则以外,不同的预测方法还会根据各自总结的规律对算法进行限制和优化。

5,什么叫miRNA的上调

现在有很多人研究miRNA表达谱,研究miRNA的异常表达,来研究病因。举例来说,与正常人样本相比,肺癌的hsa-miR-122过度表达,检测峰度高很多,就属于miRNA异常。而hsa-miR-144过低表达,也属于异常。当研究hsa-miR-144时,就可以通过各种方式,加强其表达(如miRNA mimics),以观察其功能表现,也叫miRNA功能获得性研究。
mirna通过与转录本的相互作用,关闭或抑制基因的表达。最近的研究表明它们影响了约三成的基因。mirna在多个组织中差异表达,这就让表达图谱分析成为研究的重点。同时,mirna的过表达和抑制也是近年来常用的研究方法。然而,peng jin(埃默里大学)我们使用rna oligo和载体的方法。对于rna oligo方法,我们采用类似sirna双链的mirna,及anti-mirna来增加或阻断特定mirna的活性。这种方法便于操控细胞培养中特定mirna的活性。载体方法有着长期改变的优势,能够追踪个别细胞。我们利用人工的shrna质粒或pol ii表达载体,来过表达特定的mirna。对于mirna的下调,我们要么表达一个shrna,它能产生与mirna前体的茎环结构互补的sirna,要么使用mirna海绵(mirna sponge),它能在特定mirna的多个目标位点表达报告基因。winston kuo(哈佛大学)目前有两种通用策略:1) 基于载体或病毒的mirna或mirna反义链序列的过表达;2) 外源mirna双链或反义抑制剂的转染。方法的选择取决于实验的设计。一般说来,我们倾向于外源试剂的转染。载体/病毒的策略还依赖drosha/dicer酶对转录本的顺序加工,且必须通过exportin 5从核中输出。在人类癌细胞系中曾报道过drosha和dicer水平的mirna加工缺陷。此外,exportin 5也被认为是细胞和小鼠模型中mirna生物发生途径的瓶颈。外源过表达可饱和exportin 5,从而胜过内源小rna序列。极端的情况下会引起细胞或动物死亡。外源双链转染后,直接进入risc复合物中,因而绕过了这些陷阱。当然,在需要持久的功能获得或功能丧失时,还需要载体或病毒的稳定表达。稳定的细胞系必须小心地建立,采用病毒滴度测定来避免上述问题。joshua mendell(约翰霍普金斯大学)对于mirna的上调,我们常常构建表达载体。制备起来非常简单。我们只是扩增mirna发夹结构及一些侧翼序列,并直接克隆pcr产物。有时候,我们也用合成的mirna模拟物来瞬时转染细胞,以过表达mirna。为了抑制mirna,我们一般使用市场上的反义寡核苷酸。我们使用dharmacon和exiqon的抑制剂都获得了成功。这些试剂的局限在于它们只能瞬时作用。为了实现稳定抑制,我们开始用所谓的mirna海绵。它们实际上是有着多个mirna结合位点的捕获转录本,能隔离细胞中有活性的mirna。silvia monticelli(瑞士生物医学研究所)我们主要使用慢病毒或反转录病毒系统,因为我们主要研究原代细胞,而且需要长时间的持续表达。取决于细胞类型,我们也使用lipofectamine或amaxa来瞬时转染。对于下调,我们正使用mirna海绵。对于短期研究,mirna抑制剂的瞬时转染效果也很好。galina gabriely(哈佛大学)为了评估处理后mirna的活性,我们测定了与mirna结合位点融合的萤光素酶的表达。不过,评估mirna活性的最佳方法是评估它的天然靶点的表达(如果mirna靶点已知)。这可以通过western blot分析来进行。mirna表达的调节可用northern blot分析来评估mirna的表达水平。在某些情况下,定量rt-pcr也能给出mirna表达的可靠结果,但mirna调节所使用的寡核苷酸会在pcr反应中干扰引物,从而影响真实的表达数据。winston kuo(哈佛大学)我们使用几种策略,包括mirna qpcr,mirna northern blot,萤光素酶报告分析,mrna靶点的qpcr,以及蛋白靶点的western blot。在上面我已经讨论了mirna qpcr和northern blotting。这些能够直接检测mirna过表达或下调。萤光素酶报告分析包括3-utr序列克隆在萤光素酶编码序列的下游。这些3-utr包含了人工的mirna同源位点或已验证mrna靶点的内源序列。后一个策略中的关键对照是生成假定同源位点上种子序列的点突变。这些点突变将使mirna不能调节萤光素酶的表达。joshua mendell(约翰霍普金斯大学)为了验证mirna上调,我们还是使用northern blotting或实时定量pcr来测定mirna的丰度。测定mirna的抑制就没那么简单。反义oligo确实降低了mirna的丰度。因此,你也可以用同样的方法来监控mirna抑制。不过,体内mirna的隔离不会总是让mirna丰度下降。另一个方法是用报告基因重组子来监控mirna的抑制。mirna会抑制报告基因的表达,除非它的活性受阻。当然,这种报告基因的使用一般受限于细胞培养环境。silvia monticelli(瑞士生物医学研究所)这些实验中的关键一步是:通过转染或转导细胞,你有效地改变了它们,因此你的确需要很多对照,来确认你所看到的结果是来自mirna的表达或下调。这对mirna尤其重要,因为在很多情况下,你并不期待一个强的表型,但是你在寻找微调基因表达的温和效果。我想你至少需要目的mirna之外的mirna和种子区域的突变体。我还推荐使用不同方法来设法获得相同的结果。

文章TAG:什么  基因  上调  调和  什么是基因上调  
下一篇