25bp的bp是什么意思,pcr引物要多长才具有特异性呀4bp的引物随机出现概率为256分之一
来源:整理 编辑:金融知识 2023-07-18 21:02:38
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1,pcr引物要多长才具有特异性呀4bp的引物随机出现概率为256分之一
PCR引物一般是18-25bp吧,没见过用10-12个做PCR的,退火温度太低了,特异性差。
4bp随机引物,每一个bp都有AGCT四种可能,所以一共是4*4*4*4=256种可能。那么,某一种特定序列的出现概率就是1/256。
最少得6个碱基 推荐8——15个 一般选10个到12个
2,什么是实时荧光定量PCR有什么应用领域与传统PCR有什么区别
.荧光共振能量传递 (FRET)某荧光标记基团在激发光刺激下生成某波长的发射光,当另一屏蔽基团与其距离合适时,原发射光将会被屏蔽基团所吸收,并转化为其他波长的发射光或热能,称之为FRET。2.荧光化学:荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5-3外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。二.实时荧光PCR技术靶基因的确定及引物和探针的设计原则1.靶基因的确定:选择检测组共有的基因以避免检测的假阴性(漏检)。2.检测片段的确定:选择检测组内的保守 (突变少)(避免假阴性)、组间特异的序列 (突变多)(避免假阳性)作为引物探针的设计位置。片段长度70-150bp。3.引物:长度17-25bp;GC含量30-80%;退火温度(Tm值)58-60℃;避免稳定的引物二聚体(特别是多联检测)及发夹结构(自由能大于-3.5kc/m);序列不能出现连续的G,3端避免G或C,最后5个碱基内避免两个以上的G或C。4.探针:长度20-30bp(Taqman)或16-25bp(MGB);GC含量30-80%;Tm值为68-70℃;避免稳定的二聚体及发夹结构 (自由能大于-3.5kc/m);5端不能是G;位置尽量靠近上游引物;选择波长差异较大(多联检测)或Fam(单联检测)的荧光标记。三.特点和优势1.特异性强:引物和探针的“双保险”,避免检测的假阳性。2.灵敏度高:分析PCR产物的对数期,自动化仪器收集荧光信号,避免了许多人为因素干扰。3.避免污染:全封闭反应,无须PCR后处理。4.实现定量:运用标准品获得标准曲线,结合Ct值进行准确定量。5.高效低耗:可实现一管多检。6.操作简便:在线式实时监测扩增结果,不必接触有害物质。7.快速:反应时间<1.5小时。四.实用意义:1.提高检测效率,缩短检测周期,提高通关速度;2.降低检测成本,提高经济与社会效益。
3,那位知道DNA 荧光探针的PCR标记方法用什么酶最好
荧光共振能量传递 (FRET) 某荧光标记基团在激发光刺激下生成某波长的发射光,当另一屏蔽基团与其距离合适时,原发射光将会被屏蔽基团所吸收,并转化为其他波长的发射光或热能,称之为FRET。 2.荧光化学: 荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5-3外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。 二.实时荧光PCR技术靶基因的确定及引物和探针的设计原则 1.靶基因的确定:选择检测组共有的基因以避免检测的假阴性(漏检)。 2.检测片段的确定:选择检测组内的保守 (突变少)(避免假阴性)、组间特异的序列 (突变多)(避免假阳性)作为引物探针的设计位置。片段长度70-150bp。 3.引物:长度17-25bp;GC含量30-80%;退火温度(Tm值)58-60℃;避免稳定的引物二聚体(特别是多联检测)及发夹结构(自由能大于-3.5kc/m);序列不能出现连续的G,3端避免G或C,最后5个碱基内避免两个以上的G或C。 4.探针:长度20-30bp(Taqman)或16-25bp(MGB);GC含量30-80%;Tm值为68-70℃;避免稳定的二聚体及发夹结构 (自由能大于-3.5kc/m);5端不能是G;位置尽量靠近上游引物;选择波长差异较大(多联检测)或Fam(单联检测)的荧光标记。 三.特点和优势 1.特异性强:引物和探针的“双保险”,避免检测的假阳性。 2.灵敏度高:分析PCR产物的对数期,自动化仪器收集荧光信号,避免了许多人为因素干扰。 3.避免污染:全封闭反应,无须PCR后处理。 4.实现定量:运用标准品获得标准曲线,结合Ct值进行准确定量。 5.高效低耗:可实现一管多检。 6.操作简便:在线式实时监测扩增结果,不必接触有害物质。 7.快速:反应时间<1.5小时。 四.实用意义: 1.提高检测效率,缩短检测周期,提高通关速度; 2.降低检测成本,提高经济与社会效益。PCR技术是利用两种寡核苷酸引物,分别与双链DNA片段的两端互补,形成DNA聚合酶反应中的模板和引物的关系,这就是PCR技术的核心。普遍引物设计用TaqDNA聚合酶。病毒量是1.61*10的6次方 应该治疗一下 哈医大四院乙肝生物治疗中心为你解答 望采纳或追问
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